国家级科研机构
| 机构名称 | 批复单位 | 批复年份 | 挂靠单位 |
| 电子商务信息处理国际联合研究中心 | 科技部 | 2013 | 信息工程学院 |
| 电子商务交易技术国家地方联合工程实验室（江苏） | 国家发展和改革委 | 2015 | 信息工程学院 |
| 粮食储运国家工程研究中心（共建） | 国家发展和改革委 | 2021 | 食品科学与工程学院 |
| 机构名称 | 批复单位 | 批复年份 | 挂靠单位 |
| 电子商务信息处理国际联合研究中心 | 科技部 | 2013 | 信息工程学院 |
| 电子商务交易技术国家地方联合工程实验室（江苏） | 国家发展和改革委 | 2015 | 信息工程学院 |
| 粮食储运国家工程研究中心（共建） | 国家发展和改革委 | 2021 | 食品科学与工程学院 |
仙林校区：南京市仙林大学城文苑路3号 210023
福建路校区：南京市鼓楼区铁路北街128号 210003
桥头校区：江苏省镇江市桥头 212413
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